马铃薯病害种类多，其中北方的晚疫病和南方的病毒病最为严重，一旦发病难以控制，应采取以这两大病害为中心兼治其他病害的综合防治措施。

1、各产区建立无病薯良种体系和繁育基地。通过精选。脱毒苗、实生苗等方法提供无病毒、无病菌优良种薯。自繁的可用二季作种薯（各种病毒病、晚疫病、粉痂病等）

2、严格执行检疫制度，不得从疫区调种。播种前精选种薯或进行消毒。环腐病区整薯播种（粉痂病、疮闸病、环腐病、晚疫病等多种薯传病害）。

3、实行与非茄科蔬菜的3年轮作（多种薯块病害）。

4、针对本地区主要病害选用抗病品种。

5、推广配方施肥技术，增强植株抗病性（晚疫病、早疫病等）。

6、采取高畦栽培，适时培土，加强风严防大水漫灌（晚疫病、早疫病、粉痂病）。

7、苗期大面积防蚜，发现病及早拔除处理（病毒病和其他病害）。

8、针对本地发病情况，在开花前后预防喷药1：1：200波尔多液，不仅有防病效果，且有刺激生长作用。或者喷洒百菌清、甲霜铜、代森锰锌等合成杀菌剂（晚疫病、早疫病）。

9、收获在晴天干燥天气进行。在风遮阴处凉干几天，使皮下形成木质层。防止直射光（所有病害）。

10、贮存前剔除病薯和仿薯。在病地收获的薯块及早处理（所有病害）。

11、收获完及时清理田间病薯、病秧、携出田外销毁（所有病害）。