水稻胡麻叶斑病病原为半知菌亚门长蠕孢属真菌，病菌以菌丝体在病稻草与颖壳内，或以分生孢子附着在种子和病稻草上越冬，成为次年初侵染源。

水稻胡麻叶斑病从秧苗期到收获期均可发病，稻株地上部均能受害，以叶片受害为主。成株叶片受害，病斑初为褐色小点，逐渐扩大成椭圆形褐斑，芝麻粒大小，病斑周围一般有黄色晕圈，后期中央呈黄褐色或灰白色。缺氮的稻株病斑较小；缺钾的较大，且病斑中的轮纹明显。病重时叶片上病斑密布，常愈合成不规则的大斑，最后叶片干枯。受害严重的稻株，生长受阻，分蘖少，抽穗迟。需要注意的是，水稻缺钾也会引起缺钾性胡麻叶斑病，注意区分。水稻缺钾叶片从下位叶开始出现赤褐色焦尖和斑点，并逐渐向上位叶扩展，严重时田间水稻叶片发红如火燎状。

水稻胡麻叶斑病发生初期可以用丙森锌、稻瘟灵、咪鲜胺、异稻瘟净等药喷雾防治。