采用以抗病品种为基础，化学防治为主，农业保健栽培措施为辅的综合防治技术。

1、种植抗病品种，选用优良种子，保证发芽势强，提高抗病性。

2、减少菌源，结合农事操作在苗期拔除病株。

3、加强农业保健栽培措施。调整播期和提高播种质量，根据地势、土质、品种生育期和抗病性灵活掌握播种时间。

4化学防治。使用种衣剂是防治玉米丝黑穗病最直接、经济、有效的措施之一。